chore: 清理 pi-mcp-adapter 移除后的陈旧引用

Pi 0.99+ 已内置 MCP（builtin:mcp），组合包不再加载 adapter；
删除引用不存在 mcp 工具的 mcp-management 分组，并把权限文档
中的 MCP 表述澄清为内置 mcp__<server>__<tool> 命名。

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AGENTS.md

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 - Codex native compaction 必须直接消费当前 projection 生成的 ResponseItems，不得从 raw branch 重建输入；native checkpoint 同时保存有界 portable summary 供模型或 Provider 切换。配置只从 `settings.json.piCompaction` 读取且不写回，默认 soft/hard/target 比例为 72%/90%/55%。
 - Kitty 完成通知只在 TUI 模式的 `agent_settled` 后发送；自动重试、自动 compaction 和 follow-up 期间不得提前通知或重置总耗时。权限通知只订阅 `permissions:ui_prompt`，在人类确认界面即将出现时立即发送，不得为策略或 AutoReview 已直接决定的请求通知，也不受完成通知时长门槛影响。默认 `o=always`、`a=focus`，每个 Pi Session 使用独立稳定 ID，标题和正文必须 Base64 编码。
 - `/notify on|off` 只覆盖当前 Session；持久默认来自 `PI_NOTIFY_*` 环境变量。`PI_NOTIFY_MESSAGE_SOURCE=none` 必须继续提供不泄露回复正文、权限值或请求者细节的隐私模式，非 TUI 模式不得写入 OSC 序列。
-- 权限策略默认允许常规工具，允许 FFF 工具；拒绝 Bash 直搜，硬防御默认只保留确定性的破坏性 Shell 命令；Git 非只读操作、包管理、文件/系统/网络高风险操作与普通 MCP 调用按唯一全局 policy 判定。项目外路径不再产生独立 `external_directory` 判断，只走配置中的工具、`path` 与 Bash pattern。
+- 权限策略默认允许常规工具，允许 FFF 工具；拒绝 Bash 直搜，硬防御默认只保留确定性的破坏性 Shell 命令；Git 非只读操作、包管理、文件/系统/网络高风险操作与内置 MCP 的 `mcp__<server>__<tool>` 调用按唯一全局 policy 判定。项目外路径不再产生独立 `external_directory` 判断，只走配置中的工具、`path` 与 Bash pattern。
 - SSH 权限沿用同一条 `pi-permission-system` gate 与 `auto-review` authorizer chain：`ssh_connect`、`ssh_cd`、`ssh_read`、`ssh_write`、`ssh_edit`、`ssh_find`、`ssh_grep` 默认 `ask`；连接前的证据解析已导入 host ID 为非秘密 target、port 与请求/default cwd，AutoReview 只可依据用户直接消息中的明确目标授权连接。`ssh_bash` 通过 `shellTools` 映射到完整 Bash 策略并设置 `decisionFloor: "ask"`，把普通 Bash `allow` 提升为复核请求，同时保留原有 `ask` 与硬 `deny`。全部远端路径不得送入基于本机 cwd 的默认 `input.path` 归一化。
 - `auto-review` 是 `pi-permission-system` 内置 authorizer，不是独立扩展或第二个 `tool_call` gate；只复核普通策略产生的 `ask`，不会重复处理普通策略已 `allow` / `deny` 或硬防御已 `deny` 的请求。
 - reviewer 是对话式 Codex Guardian 风格审查：以独立请求（不写入主会话）把有界 active-branch 对话记录与权限请求交给模型，模型只能通过 `approve` / `reject` 两个工具给出带 `reason` 的结论，不强制 `toolChoice`。`approve` 自动批准（包括 `path`）；`reject` 以及配置、模型、超时、Provider 错误、截断、未调用工具、多次调用或参数无效等一切异常都必须 `defer` 到人工提示，并在弹窗中显示原因（模型理由标注为模型生成）。正文文本即使是合法 JSON 也不得作为结论；只有用户按 Esc 中止当前操作时才直接拒绝。不得在 authorizer chain 外增加第二层内置授权范围限制，也不得恢复 annotator 机制。
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 ## 验证
 
-组合包依赖或加载入口变化时，至少验证根 `npm install` 幂等、锁文件有效、MCP adapter 唯一所有者不变量测试，以及全部扩展可在隔离的临时 Pi agent 目录加载。权限配置变化时使用仓库内固定快照的 `pi-permission-system` schema 校验，并验证包装入口部署后的文件与仓库源配置一致。
+组合包依赖或加载入口变化时，至少验证根 `npm install` 幂等、锁文件有效，以及全部扩展可在隔离的临时 Pi agent 目录加载。权限配置变化时使用仓库内固定快照的 `pi-permission-system` schema 校验，并验证包装入口部署后的文件与仓库源配置一致。
 
 安装、升级、卸载、搜索或 SSH 配置脚本变化时，至少运行 `sh -n install.sh`、`sh -n update.sh`、`sh -n uninstall.sh`、`sh -n search_config.sh`、`sh -n ssh_config.sh` 和 ShellCheck，并核对脚本仍具有可执行权限、仍包含在根 `package.json` 的 `files` 中、README 描述与实际流程一致。组合包配置重建必须用隔离 agent dir 覆盖：`my-pi/` 全量替换且内容字节一致、权限 `600`/`700`、目录外文件不受影响、空或相对 agentDir 拒绝且不删除、manifest 目标越界拒绝且不删除、`my-pi/` 为符号链接时只替换链接且不触碰目标目录；`update.sh` 中 helper 无法定位时必须记录失败且不回退脚本目录。搜索配置测试只能使用虚拟 key 和隔离 HOME；SSH 配置测试必须使用隔离 HOME、虚拟凭据与 mock transport，不得连接真实服务器或把真实密码写入测试输出。涉及真实 `pi install`、`pi update`、`pi remove`、Homebrew、远程安装器、Git 克隆、真实 SSH 连接或真实用户终端配置的端到端验证属于外部写操作，未经明确要求不得执行；可以使用隔离的临时 HOME 和 mock 命令验证分支行为。